Tecnología que permite hacer secuenciación masiva de fragmentos de 200 pb mediante lecturas en un chip semiconductor. La información que se puede llegar a tener es de 10 GB (Gigabytes). Actualmente el laboratorio desarrolla proyectos de secuenciación de Genoma de Hongos y  en la búsqueda de metagenomas de reactores generadores de metano (Colaboración con el Departamento de Agroindustrias).